Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vpreb1P13372 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb1P13372 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms