Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RaraP11416 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RaraP11416 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaraP11416 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaraP11416 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaraP11416 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaraP11416 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RaraP11416 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaraP11416 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaraP11416 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaraP11416 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RaraP11416 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaraP11416 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaraP11416 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaraP11416 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaraP11416 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaraP11416 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaraP11416 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaraP11416 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RaraP11416 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RaraP11416 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaraP11416 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaraP11416 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RaraP11416 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaraP11416 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaraP11416 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaraP11416 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaraP11416 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaraP11416 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaraP11416 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RaraP11416 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaraP11416 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaraP11416 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaraP11416 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaraP11416 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaraP11416 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RaraP11416 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaraP11416 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RaraP11416 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RaraP11416 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RaraP11416 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RaraP11416 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RaraP11416 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RaraP11416 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaraP11416 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaraP11416 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaraP11416 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaraP11416 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaraP11416 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RaraP11416 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RaraP11416 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RaraP11416 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RaraP11416 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms