Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fv4P11370 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fv4P11370 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fv4P11370 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fv4P11370 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fv4P11370 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fv4P11370 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fv4P11370 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fv4P11370 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fv4P11370 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fv4P11370 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fv4P11370 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fv4P11370 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fv4P11370 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms