Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Tnp1P10856 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms