Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P10404 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P10404 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P10404 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P10404 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P10404 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P10404 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P10404 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P10404 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P10404 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P10404 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P10404 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P10404 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
P10404 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
P10404 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
P10404 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
P10404 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
P10404 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P10404 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P10404 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P10404 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P10404 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P10404 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P10404 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P10404 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P10404 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P10404 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P10404 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P10404 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P10404 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P10404 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P10404 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P10404 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P10404 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P10404 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P10404 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P10404 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P10404 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P10404 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P10404 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P10404 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P10404 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P10404 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P10404 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P10404 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
P10404 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P10404 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P10404 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P10404 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P10404 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P10404 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P10404 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P10404 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms