Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Amd1P0DMN7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Amd1P0DMN7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms