Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtaP09225 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LtaP09225 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtaP09225 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtaP09225 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtaP09225 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtaP09225 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtaP09225 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtaP09225 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtaP09225 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtaP09225 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LtaP09225 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtaP09225 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LtaP09225 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtaP09225 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtaP09225 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtaP09225 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtaP09225 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtaP09225 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LtaP09225 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtaP09225 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtaP09225 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtaP09225 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtaP09225 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtaP09225 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtaP09225 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtaP09225 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LtaP09225 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtaP09225 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtaP09225 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtaP09225 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtaP09225 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtaP09225 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtaP09225 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtaP09225 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtaP09225 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LtaP09225 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtaP09225 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LtaP09225 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtaP09225 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LtaP09225 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtaP09225 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LtaP09225 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtaP09225 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtaP09225 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtaP09225 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LtaP09225 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LtaP09225 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtaP09225 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtaP09225 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtaP09225 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtaP09225 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtaP09225 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtaP09225 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtaP09225 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtaP09225 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtaP09225 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtaP09225 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtaP09225 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtaP09225 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtaP09225 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms