Protein–RNA interactions for Protein: P07607

Tyms, Thymidylate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TymsP07607 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TymsP07607 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TymsP07607 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TymsP07607 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TymsP07607 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TymsP07607 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TymsP07607 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TymsP07607 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TymsP07607 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TymsP07607 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TymsP07607 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TymsP07607 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TymsP07607 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TymsP07607 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TymsP07607 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TymsP07607 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TymsP07607 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TymsP07607 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TymsP07607 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TymsP07607 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TymsP07607 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TymsP07607 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TymsP07607 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TymsP07607 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TymsP07607 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TymsP07607 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TymsP07607 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TymsP07607 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TymsP07607 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TymsP07607 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TymsP07607 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TymsP07607 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TymsP07607 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TymsP07607 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TymsP07607 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TymsP07607 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TymsP07607 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TymsP07607 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TymsP07607 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TymsP07607 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TymsP07607 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TymsP07607 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TymsP07607 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TymsP07607 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms