Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ItgamP05555 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ItgamP05555 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgamP05555 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgamP05555 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgamP05555 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms