Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apba3O88888 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apba3O88888 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apba3O88888 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apba3O88888 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apba3O88888 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apba3O88888 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apba3O88888 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apba3O88888 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apba3O88888 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba3O88888 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba3O88888 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba3O88888 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba3O88888 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba3O88888 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba3O88888 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms