Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd160O88875 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd160O88875 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd160O88875 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd160O88875 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd160O88875 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd160O88875 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd160O88875 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd160O88875 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd160O88875 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd160O88875 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd160O88875 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd160O88875 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd160O88875 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms