Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nptx2O70340 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nptx2O70340 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms