Protein–RNA interactions for Protein: O70274

Ptp4a2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a2O70274 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptp4a2O70274 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptp4a2O70274 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptp4a2O70274 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptp4a2O70274 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptp4a2O70274 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptp4a2O70274 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptp4a2O70274 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptp4a2O70274 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptp4a2O70274 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms