Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole2O54956 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole2O54956 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole2O54956 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole2O54956 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole2O54956 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pole2O54956 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pole2O54956 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms