Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1i2O54915 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1i2O54915 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1i2O54915 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1i2O54915 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1i2O54915 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1i2O54915 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1i2O54915 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1i2O54915 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1i2O54915 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1i2O54915 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1i2O54915 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nr1i2O54915 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms