Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EdaO54693 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EdaO54693 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EdaO54693 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EdaO54693 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EdaO54693 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EdaO54693 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EdaO54693 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EdaO54693 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EdaO54693 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EdaO54693 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EdaO54693 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EdaO54693 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EdaO54693 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EdaO54693 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EdaO54693 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EdaO54693 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EdaO54693 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EdaO54693 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EdaO54693 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EdaO54693 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EdaO54693 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EdaO54693 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EdaO54693 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EdaO54693 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EdaO54693 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EdaO54693 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EdaO54693 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EdaO54693 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EdaO54693 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EdaO54693 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EdaO54693 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EdaO54693 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EdaO54693 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EdaO54693 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EdaO54693 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EdaO54693 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EdaO54693 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EdaO54693 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EdaO54693 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EdaO54693 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EdaO54693 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EdaO54693 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EdaO54693 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EdaO54693 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EdaO54693 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EdaO54693 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EdaO54693 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EdaO54693 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EdaO54693 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EdaO54693 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EdaO54693 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EdaO54693 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EdaO54693 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EdaO54693 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EdaO54693 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EdaO54693 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EdaO54693 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EdaO54693 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EdaO54693 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EdaO54693 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EdaO54693 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EdaO54693 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EdaO54693 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EdaO54693 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EdaO54693 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EdaO54693 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EdaO54693 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EdaO54693 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EdaO54693 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EdaO54693 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms