Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab33bO35963 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab33bO35963 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab33bO35963 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms