Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PnnO35691 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PnnO35691 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PnnO35691 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PnnO35691 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PnnO35691 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PnnO35691 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PnnO35691 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PnnO35691 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PnnO35691 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PnnO35691 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PnnO35691 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PnnO35691 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PnnO35691 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PnnO35691 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PnnO35691 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PnnO35691 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PnnO35691 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PnnO35691 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PnnO35691 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnnO35691 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnnO35691 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnnO35691 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnnO35691 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnnO35691 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnnO35691 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnnO35691 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnnO35691 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnnO35691 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PnnO35691 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PnnO35691 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PnnO35691 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PnnO35691 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PnnO35691 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PnnO35691 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PnnO35691 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PnnO35691 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PnnO35691 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PnnO35691 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PnnO35691 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PnnO35691 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PnnO35691 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PnnO35691 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PnnO35691 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PnnO35691 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PnnO35691 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PnnO35691 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PnnO35691 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PnnO35691 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PnnO35691 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PnnO35691 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PnnO35691 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PnnO35691 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PnnO35691 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PnnO35691 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PnnO35691 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PnnO35691 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PnnO35691 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PnnO35691 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnnO35691 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnnO35691 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnnO35691 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnnO35691 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnnO35691 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnnO35691 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnnO35691 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnnO35691 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnnO35691 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PnnO35691 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PnnO35691 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PnnO35691 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PnnO35691 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PnnO35691 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PnnO35691 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PnnO35691 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PnnO35691 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PnnO35691 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnnO35691 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnnO35691 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnnO35691 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnnO35691 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnnO35691 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnnO35691 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PnnO35691 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnnO35691 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnnO35691 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PnnO35691 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PnnO35691 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PnnO35691 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PnnO35691 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PnnO35691 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PnnO35691 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PnnO35691 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PnnO35691 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PnnO35691 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PnnO35691 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PnnO35691 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PnnO35691 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PnnO35691 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PnnO35691 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms