Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnfrsf11aO35305 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfrsf11aO35305 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfrsf11aO35305 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.8 ms