Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smad6O35182 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smad6O35182 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smad6O35182 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad6O35182 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smad6O35182 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad6O35182 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smad6O35182 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms