Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snap23O09044 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snap23O09044 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snap23O09044 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snap23O09044 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap23O09044 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Snap23O09044 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snap23O09044 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap23O09044 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap23O09044 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap23O09044 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap23O09044 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snap23O09044 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap23O09044 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Snap23O09044 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms