Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LfngO09010 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LfngO09010 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LfngO09010 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LfngO09010 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LfngO09010 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LfngO09010 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LfngO09010 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LfngO09010 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LfngO09010 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LfngO09010 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LfngO09010 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LfngO09010 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LfngO09010 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LfngO09010 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LfngO09010 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LfngO09010 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LfngO09010 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LfngO09010 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LfngO09010 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LfngO09010 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LfngO09010 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LfngO09010 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LfngO09010 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LfngO09010 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LfngO09010 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LfngO09010 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LfngO09010 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LfngO09010 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LfngO09010 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LfngO09010 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LfngO09010 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LfngO09010 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LfngO09010 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LfngO09010 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LfngO09010 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LfngO09010 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LfngO09010 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LfngO09010 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LfngO09010 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LfngO09010 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LfngO09010 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LfngO09010 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LfngO09010 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LfngO09010 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LfngO09010 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LfngO09010 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LfngO09010 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LfngO09010 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LfngO09010 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LfngO09010 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LfngO09010 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LfngO09010 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LfngO09010 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LfngO09010 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LfngO09010 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LfngO09010 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LfngO09010 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LfngO09010 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms