Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsmbO08540 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MsmbO08540 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MsmbO08540 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsmbO08540 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsmbO08540 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsmbO08540 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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