Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm9602J3QPD5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm9602J3QPD5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms