Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21972J3QN38 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm21972J3QN38 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms