Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
7530416G11RikJ3QJX6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
7530416G11RikJ3QJX6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms