Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm29394H3BIW7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm29394H3BIW7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm29394H3BIW7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms