Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3tc1G3X9F6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3tc1G3X9F6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3tc1G3X9F6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3tc1G3X9F6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms