Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zkscan2G3X952 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zkscan2G3X952 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zkscan2G3X952 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms