Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9a3G3X939 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc9a3G3X939 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc9a3G3X939 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms