Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
XntrpcF8VQM8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XntrpcF8VQM8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XntrpcF8VQM8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XntrpcF8VQM8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XntrpcF8VQM8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XntrpcF8VQM8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XntrpcF8VQM8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XntrpcF8VQM8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XntrpcF8VQM8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms