Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srp72F8VQC1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srp72F8VQC1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srp72F8VQC1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms