Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
5830473C10RikF8VQ07 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
5830473C10RikF8VQ07 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
5830473C10RikF8VQ07 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms