Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Farp1F8VPU2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Farp1F8VPU2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms