Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h7bF8VPP8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zc3h7bF8VPP8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zc3h7bF8VPP8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms