Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms