Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm29094F6Q785 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29094F6Q785 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29094F6Q785 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms