Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod3E9QA62 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lmod3E9QA62 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmod3E9QA62 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms