Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc121E9Q6D3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc121E9Q6D3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc121E9Q6D3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms