Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
8030474K03RikE9Q4Y8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms