Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2Z4

Gm16494, Predicted gene 16494, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16494E9Q2Z4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm16494E9Q2Z4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm16494E9Q2Z4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm16494E9Q2Z4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms