Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt78E9Q0F0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms