Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx60E9PZQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ddx60E9PZQ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx60E9PZQ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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