Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syde2E9PUP1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syde2E9PUP1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms