Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem200bD3Z0P8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem200bD3Z0P8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem200bD3Z0P8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms