Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc8D3YZV8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc8D3YZV8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc8D3YZV8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms