Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SafbD3YXK2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SafbD3YXK2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SafbD3YXK2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.1 ms