Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc11B2RXC1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc11B2RXC1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms