Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clrn2B2RVW2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clrn2B2RVW2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clrn2B2RVW2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms