Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5483B2RV77 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5483B2RV77 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5483B2RV77 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm5483B2RV77 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5483B2RV77 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms